由倫敦國王學院癌癥與藥物科學學院和免疫學與微生物科學學院以及弗朗西斯克里克研究所癌癥系統(tǒng)生物學實驗室的一組研究人員在 Francesca Ciccarelli 教授的帶領下發(fā)表了新論文，展示了用于分析復雜藥物的新型軟件組織成像數(shù)據(jù)。
最近開發(fā)的多路復用成像技術，例如成像質(zhì)譜流式細胞儀 (IMC)，能夠詳細研究組織細胞組成，這對于繪制疾病的組織水平特征和預測依賴于組織環(huán)境的治療結果具有特殊價值，例如癌癥免疫治療。這些技術通常會產(chǎn)生大量難以分析的高維數(shù)據(jù)，并且通常需要多種工具和具有計算專業(yè)知識的用戶。
SIMPLI(來自多重圖像的單細胞識別)是一種靈活的軟件，它統(tǒng)一了多重成像數(shù)據(jù)分析的所有步驟，也為非專業(yè)人士提供了高維成像數(shù)據(jù)分析的改進替代方案。SIMPLI 對每個組織載玻片進行空間分辨的單細胞分析，并對標記表達進行與細胞無關的量化，以研究在細胞水平上無法檢測到的特征。它還生成表格和圖形輸出，便于在分析的每個步驟中對結果進行目視檢查。
“幾年前我們開始使用高維 IMC 數(shù)據(jù)時，用于分析的工具并不多。多虧了博士 Michele Bortolomeazzi 的才華，開發(fā)我們自己的工具非常有趣. 由 CRUK KHP 中心資助的學生，并利用 Jo Spencer 教授在組織組織學方面的豐富專業(yè)知識，”Francesca Ciccarelli 教授說。
為了測試 SIMPLI 的性能和多功能性，研究人員分析了使用不同成像技術(包括但不限于 IMC)獲得的圖像，這些圖像的來源、大小和分辨率各不相同。
倫敦國王學院是歐洲首批擁有 Helios 成像質(zhì)譜流式細胞儀的機構之一，可在 BRC 流式細胞儀平臺上使用。
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