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多位點(diǎn)多組學(xué)分析揭示了終末期卵巢癌的多種耐藥機(jī)制

導(dǎo)讀 由澳大利亞墨爾本 MacCallum 癌癥中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的國際團(tuán)隊(duì)檢查了從 15 名晚期高級(jí)別漿液性卵巢癌 (HGSC) 患者采集的約 270 個(gè)

由澳大利亞墨爾本 MacCallum 癌癥中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的國際團(tuán)隊(duì)檢查了從 15 名晚期高級(jí)別漿液性卵巢癌 (HGSC) 患者采集的約 270 個(gè)多部位尸檢樣本中的 391 個(gè)腫瘤組織。所有提供的尸檢樣本都來自最初對(duì)癌癥治療有反應(yīng)但在復(fù)發(fā)時(shí)對(duì)這些療法產(chǎn)生抗藥性的患者。

該分析在不同程度上對(duì)收集的樣本使用了全基因組測序、靶向基因測序、RNA-seq、蛋白質(zhì)組學(xué)、甲基化和多色免疫熒光。研究人員尋找轉(zhuǎn)移部位內(nèi)部和之間的變異,重點(diǎn)關(guān)注個(gè)體患者體內(nèi)發(fā)生的耐藥機(jī)制的數(shù)量,并發(fā)現(xiàn)了從不同克隆細(xì)胞和亞克隆突變的數(shù)量到耐藥機(jī)制分布的高度變異性。

所有患者都被發(fā)現(xiàn)患有多克隆疾病,平均有 5 個(gè)克隆,從 2 個(gè)到 9 個(gè)不等。雖然癌癥可能從單克隆開始,但一個(gè)壞細(xì)胞會(huì)復(fù)制自身的克隆,擁有許多(多)克隆可能意味著癌癥來自不同細(xì)胞的多個(gè)起點(diǎn)。不同的起點(diǎn)會(huì)使評(píng)估有效的治療路徑變得更加困難,因?yàn)榉只目寺】赡軙?huì)產(chǎn)生不同的治療抗性。相比之下,單個(gè)克隆的存在將意味著可能能夠識(shí)別和克服的高效、單一的抗性機(jī)制的進(jìn)化。

來自患者體內(nèi)空間不同位點(diǎn)的耐藥性相關(guān)基因的靶向測序顯示很少有共享突變,研究人員檢測到的耐藥性機(jī)制很少存在于個(gè)體的所有樣本中。他們觀察了通常是亞克隆的趨同耐藥性和耐藥機(jī)制的例子。廣泛的基因組變異性在克隆和拷貝數(shù)異常中很明顯,它們刪除或放大了大的連續(xù)代碼段。

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