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新的NIH計劃旨在發(fā)現(xiàn)和編目人體組織中體細胞鑲嵌的廣度

導讀 美國國立衛(wèi)生研究院正在啟動一項新計劃,即共同基金的跨人體組織的體細胞鑲嵌(SMaHT)網絡,旨在改變我們對全身細胞和組織中有多少遺傳變異

美國國立衛(wèi)生研究院正在啟動一項新計劃,即共同基金的跨人體組織的體細胞鑲嵌(SMaHT)網絡,旨在改變我們對全身細胞和組織中有多少遺傳變異的認識。體細胞嵌合體是一種遺傳變異,當我們的體細胞(非生殖)細胞在遺傳上彼此不同時就會出現(xiàn)。當我們的一些細胞隨著時間的推移積累DNA變化時,就會發(fā)生這種體細胞遺傳變異。體細胞鑲嵌可以改變細胞的功能,并可能影響人類發(fā)育、疾病、衰老和其他生理指標。SMaHT網絡在五年內獲得總計140.<>億美元的獎金,等待資金到位,旨在發(fā)現(xiàn)和編目人體組織中體細胞鑲嵌的廣度。

"由于體細胞鑲嵌癥可以發(fā)生在我們身體的任何細胞類型中,它可能對我們的健康產生廣泛的影響。鑲嵌主義的廣度使得僅由一個NIH研究所或中心單獨解決的問題變得笨拙,“NIH計劃協(xié)調,規(guī)劃和戰(zhàn)略計劃部代理主任RobertEisinger博士說,該部門通過NIH共同基金為網絡提供財政支持和聯(lián)合領導。“這使得體細胞鑲嵌的研究非常適合NIH共同基金計劃,因為它的成立是為了在NIH的廣泛使命范圍內促進研究。

雖然體細胞鑲嵌癥可以發(fā)生在所有組織中,是癌癥的主要貢獻者,并且可以由外部暴露和一個人自己的內部生物過程引起,但其對人類健康和疾病的全面影響尚不清楚。通過對正常人體組織中的體細胞鑲嵌進行編目,SMaHT網絡將提供基礎知識,使研究體細胞遺傳變異在人類發(fā)育和衰老中的作用,以及廣泛的疾病和紊亂,包括未診斷的疾病和大腦,肌肉,皮膚和免疫系統(tǒng)的疾病。此外,鑒于體細胞突變對癌癥的貢獻,這一努力有可能支持拜登總統(tǒng)終結癌癥的目標,正如我們所知,這是癌癥登月計劃的一部分。

SMaHT網絡建立在其他具有里程碑意義的項目之上,如人類基因組計劃和共同基金的表觀基因組學計劃,克服了研究我們DNA部分的挑戰(zhàn),這些挑戰(zhàn)長期以來阻礙了傳統(tǒng)的DNA測序工具。例如,細胞和組織特異性遺傳變化通常發(fā)生在罕見的細胞群中,并且可能存在于難以可靠表征的重復DNA區(qū)域中。此外,人類體細胞鑲嵌的程度可能受到遺傳變化的相對時間的影響。SMaHT網絡將開發(fā)最先進的技術,以更好地檢測不同細胞類型和組織以及人類生命階段的體細胞嵌合體。

美國國立衛(wèi)生研究院國家神經疾病和中風研究所(NINDS)主任WalterKoroshetz博士指出,“隨著時間的推移,識別體細胞突變的技術,包括由于轉座元件或所謂的'跳躍基因'的運動引起的突變,將導致對年齡相關疾病的新理解。

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下載最新版本

NIH已經頒發(fā)了22個獎項來建立SMaHT網絡,其組成部分包括:

數(shù)據(jù)分析中心,用于創(chuàng)建這種體細胞遺傳變異的目錄,以及一個數(shù)據(jù)工作臺,以可視化和分析變異,該變異將與現(xiàn)有的遺傳工具和數(shù)據(jù)庫集成

工具開發(fā)項目,以創(chuàng)建新的DNA測序和分析技術,以應對檢測重復DNA序列區(qū)域和小細胞群中發(fā)生的罕見遺傳變化的挑戰(zhàn)

組織中心,負責協(xié)調網絡的活動并將網絡資源分配給研究界。

為了確保多樣化的代表性,SMaHT網絡將從包括不同祖先和不同生命階段的人類供體庫中抽取組織樣本。從每個供體收集的一組通用組織將代表全身的不同組織類型,可能包括來自大腦、血液、皮膚、肌肉、結腸、脾臟、子宮、輸精管、卵巢和睪丸的樣本。

SMaHT網絡是由NIH共同基金,國家人類基因組研究所,國家藥物濫用研究所,國家環(huán)境健康科學研究所,國家心理健康研究所和NINDS合作管理的NIH范圍的努力。

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