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基因組研究揭示了遺傳性視網(wǎng)膜疾病的不同人群

導讀 由加州大學圣地亞哥分校的科學家和加州大學圣地亞哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科學家領導的國際研究團隊拓寬并加深了對遺傳

由加州大學圣地亞哥分校的科學家和加州大學圣地亞哥分校健康中心 Shiley Eye Institute 的科學家領導的國際研究團隊拓寬并加深了對遺傳性視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良 (IRD) 如何影響不同人群的理解,并在此過程中,確定了可能導致疾病的新基因變異。

該研究結(jié)果發(fā)表在 2021 年 10 月 18 日的PLOS Genetics 上。

IRD 是一組疾病,從色素性視網(wǎng)膜炎到無脈絡膜血癥,會導致進行性視力喪失,甚至失明。每個 IRD 至少由一個基因突變引起,盡管同一基因的突變可能導致不同的 IRD 診斷。

IRD 很少見,但它們影響所有年齡段的人,以不同的速度發(fā)展,即使在患有相同疾病的家庭中也是如此。具體診斷取決于發(fā)現(xiàn)遺傳致病突變。

美國食品和藥物管理局已批準基因療法來治療一種涉及 RPE65 基因的 IRD,但對于由 280 多個不同基因突變引起的其他 IRD,尚無治愈方法或治療方法被證明可以減緩疾病進展。

研究人員對來自 108 個不相關家族譜系的 409 人進行了全基因組序列 (WGS),每個人都有先前診斷出的 IRD。WGS 是確定個體 DNA 序列的全部或接近全部的過程。它提供了一個人的整個基因組的全面畫像,包括突變和變異,可用于廣泛的比較目的。

研究參與者來自三個不同的地理區(qū)域:墨西哥、巴基斯坦和居住在美國的歐洲裔美國人。從所有參與者的血液樣本中進行基因組分析,揭示了 108 個譜系中 62 個譜系的致病變異。在 62 個家族中總共發(fā)現(xiàn)了 94 個基因變異:52 個變異以前被確定為致病基因,42 個沒有。令人驚訝的是,超過一半的新變體沒有被列入基因組聚合數(shù)據(jù)庫,這是一個國際基因組數(shù)據(jù)匯編。

總體而言,在 63% 的墨西哥參與者、60% 的巴基斯坦參與者和 48% 的歐洲美國人中檢測到了致病變異。

該研究還確定了大量特定于研究人群的新 IRD 致病突變,并揭示了導致遺傳性視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良的突變類型。大約 13% 的家族在基因組中表現(xiàn)出非典型或意外的變化。五個家族譜系在所有受影響的個體中都發(fā)生了不止一種基因的突變;一個家庭在不同的基因在不同的受影響的成員進行突變和從頭突變是在一個病人時不存在于雙方父母發(fā)現(xiàn)。

另有 8% 的家族基因組結(jié)構發(fā)生較大變化,導致遺傳性視網(wǎng)膜疾病,四個家族的初步臨床診斷根據(jù)其基因型重新分類。

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