2021年1月2日整理發(fā)布：由于其刺突 (S) 蛋白和宿主受體結(jié)合域 (RBD) 中存在大量基因組突變，SARS-CoV-2 Omicron 變體被宣布為關(guān)注變體 (VOC)。在 Omicron 變體出現(xiàn)后，全球許多國(guó)家報(bào)告了病 () 病例激增。
Omicron 的一個(gè)亞系 BA.2 的出現(xiàn)，其突變略有變化，并且關(guān)于 SARS-CoV-2 Omicron 變體的流行病學(xué)特征的信息有限，因此需要進(jìn)行更多的研究。
關(guān)于研究
在本研究中，作者對(duì) SARS-CoV-2 Omicron 變體進(jìn)行了計(jì)算機(jī)模擬和流行病學(xué)相關(guān)分析。為此，他們確定了 Omicron 變體突變對(duì)宿主-病毒相互作用的功能影響以及 Omicron 相對(duì)于特定 SARS-CoV-2 變體的流行病學(xué)優(yōu)勢(shì)。當(dāng)前的研究集中在 Omicron BA.1 的當(dāng)前和最流行的亞系上。
將在硅片分析中使用從上共享所有流感數(shù)據(jù)的全球倡議(全球共享禽流感數(shù)據(jù)倡議組織)最高收集54個(gè)國(guó)家的Omicron變異的3,604基因組序列，以12月10日，2021年的數(shù)據(jù)是用來(lái)確定奧米克的突變對(duì)毒性功能的影響、免疫逃逸和病毒傳播。使用 hCoV-19/Wuhan/WIV04/2019 作為突變分析的參考菌株，生成了具有氨基酸變化的 Omicron刺突蛋白的三維 (3D) 結(jié)構(gòu)。RBD 相關(guān)突變是使用開放分析管道確定的，該管道將酵母展示平臺(tái)與深度突變掃描相結(jié)合。該管道確定了與野生型 (WT) SARS-CoV-2 菌株相比，Omicron RBD 的氨基酸突變對(duì)血管緊張素轉(zhuǎn)換酶 2 (ACE2) 結(jié)合親和力和蛋白質(zhì)表達(dá)的影響。
隨后，從 2021 年 10 月 1 日至 2021 年 12 月 10 日，對(duì)包括 Omicron 在內(nèi)的 SARS-CoV-2 變異體的基因組序列的相對(duì)比例與最近的 病例和來(lái)自 SA 的死亡率數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較分析。這種流行病學(xué)相關(guān)性進(jìn)行了研究以了解與現(xiàn)有的 SARS-CoV-2 變體相比，Omicron 變體在毒力或傳播性方面是否具有任何流行病學(xué)優(yōu)勢(shì)。2019 年病 () 的全球流行病學(xué)數(shù)據(jù)來(lái)自 Worldometer 數(shù)據(jù)庫(kù)。
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