人類免疫學(xué)數(shù)據(jù)和工具的新開(kāi)放訪問(wèn)門戶

艾倫免疫學(xué)研究所的研究人員一直很忙。自艾倫研究所分部于 2018 年底成立以來(lái)，由免疫學(xué)家、分子和計(jì)算生物學(xué)家、工程師和其他工作人員組成的 60 人團(tuán)隊(duì)一直在建立一種新的研究方式來(lái)處理大量數(shù)據(jù)通過(guò)實(shí)驗(yàn)和分析的方式：長(zhǎng)期研究免疫系統(tǒng)在人類健康生活過(guò)程中或免疫相關(guān)疾病期間如何變化、反應(yīng)或無(wú)反應(yīng)。

現(xiàn)在，該部門為所有人建立了一個(gè)新的在線門戶網(wǎng)站，以探索他們的工作細(xì)節(jié)，并最終探索與健康和疾病相關(guān)的人類數(shù)據(jù)。

今天推出的人類免疫系統(tǒng)資源管理器是艾倫免疫學(xué)研究所面向更廣泛社區(qū)的數(shù)據(jù)共享門戶。該網(wǎng)站使用去識(shí)別和匿名數(shù)據(jù)構(gòu)建，允許科學(xué)家深入研究免疫學(xué)團(tuán)隊(duì)用于分析和管理其人類免疫學(xué)研究的方法和資源。隨著該團(tuán)隊(duì)對(duì)免疫健康和疾病的長(zhǎng)期研究完成，這些數(shù)據(jù)也將存儲(chǔ)在公共門戶上。研究人員希望通過(guò)向公眾公開(kāi)他們的數(shù)據(jù)，科學(xué)界的其他人將梳理這些數(shù)據(jù)，以對(duì)人類免疫學(xué)提出自己的見(jiàn)解，最終可能為免疫相關(guān)疾病帶來(lái)更好、更精確的療法。

隨著免疫學(xué)團(tuán)隊(duì)建立了一個(gè)專門的流程，也稱為研究管道，以開(kāi)展對(duì)人類免疫健康和疾病的多年研究，包括對(duì) 、癌癥和自身免疫性疾病的免疫系統(tǒng)研究，他們意識(shí)到他們需要開(kāi)發(fā)新的方法來(lái)研究免疫系統(tǒng)并分析結(jié)果數(shù)據(jù)。由于他們繼續(xù)跟蹤健康和患者志愿者兩年或更長(zhǎng)時(shí)間，開(kāi)放訪問(wèn)平臺(tái)上的第一個(gè)公開(kāi)版本包含與這些新開(kāi)發(fā)的方法相關(guān)的數(shù)據(jù)和工具。長(zhǎng)期研究本身的數(shù)據(jù)將在未來(lái)幾年在公共門戶網(wǎng)站上發(fā)布。

第一個(gè)公開(kāi)版本包括：

描述該團(tuán)隊(duì)研究流程的協(xié)議，該流程除了臨床數(shù)據(jù)外，還隨時(shí)間從同一個(gè)人身上捕獲并整合了五種不同類型的人體免疫系統(tǒng)分子數(shù)據(jù)

一種名為 TEA-seq 的新方法和隨附的數(shù)據(jù)可視化應(yīng)用程序，可同時(shí)從單個(gè)人體免疫細(xì)胞中捕獲三種類型的數(shù)據(jù)：細(xì)胞表面存在的蛋白質(zhì);在每個(gè)細(xì)胞中開(kāi)啟或表達(dá)的一組基因;以及細(xì)胞的“表觀遺傳”景觀，它提供了有關(guān)其基因如何被調(diào)節(jié)的線索

數(shù)據(jù)和伴隨的交互式可視化團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)延遲處理人類血液樣本會(huì)改變免疫細(xì)胞的某些分子特性(這一發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致團(tuán)隊(duì)及其外部合作者在從研究志愿者身上采集血液樣本后標(biāo)準(zhǔn)化快速處理血液樣本)

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