人體組織由排列成復雜結構的不同細胞類型組成，這些細胞在單個細胞內和細胞之間發(fā)送蛋白質信號。在標準蛋白質組學測量中，這些細胞結構混合在一起，將信號網絡混合在一起。
太平洋西北國家實驗室 (PNNL) 的科學家使用染色的人類胰腺樣本來實現(xiàn)胰腺胰島(產生胰島素的微器官)區(qū)域的可視化，并展示如何使用 microPOTS 蛋白質組技術來表征區(qū)域特異性蛋白質信號。
這種方法揭示了人類胰腺樣本中的胰島素信號蛋白位于胰島細胞周圍，而不是更遠的地方。他們的研究發(fā)表在《分子與細胞蛋白質組學》上上。
目前，大多數(shù)源自基因、轉錄本、蛋白質或代謝物的組學測量均來自大塊組織。然而，當科學家測量整個組織片段時，經常會錯過生物樣本中發(fā)生的微觀變化。
該研究展示了如何將標準分析流程用于空間蛋白質組學測量，使研究人員能夠識別整個組織中無法在大塊組織水平上測量的趨勢。通過應用這些計算工具應用于 microPOTS 數(shù)據，可以識別組織特定區(qū)域內發(fā)生變化的生物信號傳導途徑。這一發(fā)現(xiàn)證明這些計算方法可用于解釋額外的空間蛋白質組學測量并識別新的生物學。
現(xiàn)有技術目前無法滿足對臨床上可用的方法來匹配異質組織內蛋白質活性的需求。 MicroPOTS可用于測量相對蛋白微米級樣品中的豐度以及每次測量的空間位置，從而將生物學上感興趣的蛋白質和通路與不同區(qū)域聯(lián)系起來。然而，考慮到測量的像素/體素數(shù)量和數(shù)量較小，標準質譜分析流程已被證明是不夠的。
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