人體組織由排列成復(fù)雜結(jié)構(gòu)的不同細(xì)胞類型組成，這些細(xì)胞在單個細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞之間發(fā)送蛋白質(zhì)信號。在標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)測量中，這些細(xì)胞結(jié)構(gòu)混合在一起，將信號網(wǎng)絡(luò)混合在一起。
太平洋西北國家實驗室 (PNNL) 的科學(xué)家使用染色的人類胰腺樣本來實現(xiàn)胰腺胰島(產(chǎn)生胰島素的微器官)區(qū)域的可視化，并展示如何使用 microPOTS 蛋白質(zhì)組技術(shù)來表征區(qū)域特異性蛋白質(zhì)信號。
這種方法揭示了人類胰腺樣本中的胰島素信號蛋白位于胰島細(xì)胞周圍，而不是更遠(yuǎn)的地方。他們的研究發(fā)表在《分子與細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)》上上。
目前，大多數(shù)源自基因、轉(zhuǎn)錄本、蛋白質(zhì)或代謝物的組學(xué)測量均來自大塊組織。然而，當(dāng)科學(xué)家測量整個組織片段時，經(jīng)常會錯過生物樣本中發(fā)生的微觀變化。
該研究展示了如何將標(biāo)準(zhǔn)分析流程用于空間蛋白質(zhì)組學(xué)測量，使研究人員能夠識別整個組織中無法在大塊組織水平上測量的趨勢。通過應(yīng)用這些計算工具應(yīng)用于 microPOTS 數(shù)據(jù)，可以識別組織特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生變化的生物信號傳導(dǎo)途徑。這一發(fā)現(xiàn)證明這些計算方法可用于解釋額外的空間蛋白質(zhì)組學(xué)測量并識別新的生物學(xué)。
現(xiàn)有技術(shù)目前無法滿足對臨床上可用的方法來匹配異質(zhì)組織內(nèi)蛋白質(zhì)活性的需求。 MicroPOTS可用于測量相對蛋白微米級樣品中的豐度以及每次測量的空間位置，從而將生物學(xué)上感興趣的蛋白質(zhì)和通路與不同區(qū)域聯(lián)系起來。然而，考慮到測量的像素/體素數(shù)量和數(shù)量較小，標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜分析流程已被證明是不夠的。
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