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研究人員對可以使家禽生病的耐藥腸炎沙門氏菌菌株的基因組進行測序

北卡羅來納州立大學的研究人員對一種劇毒腸炎沙門氏菌菌株的基因組進行了測序,該菌株連續(xù)幾年使兩個家禽群患病,發(fā)現(xiàn)它既具有抗生素抗性,又可能感染人類。對命名為 SE_TAU19 的菌株進行表征,將有助于公共衛(wèi)生機構追蹤爆發(fā)和預防暴露。

沙門氏菌有兩種,其中一種,腸道沙門氏菌,與人類疾病有關。S. enterica包含超過 2,500 種血清型或細菌群,其中許多可導致人類疾病。沙門氏菌血清型腸炎 (SE) 最常與家禽有關,是全球人類疾病的主要原因。

大多數(shù)人類沙門氏菌感染起源于食源性,許多動物(例如雞)可以攜帶病原體而不會自己生病。SE_TAU19 在感興趣的家禽中引起臨床疾病的能力 Grayson Walker,DVM 和博士。北卡羅來納州立大學獸醫(yī)學院盧克博斯特實驗室的學生,也是描述該研究的論文的第一作者。

“我們通常認為沙門氏菌被雞藏匿而不傷害它們;然而,這種菌株是有毒的,實際上使它們生病了,”沃克說。“我們也知道沙門氏菌喜歡留下來。這種菌株在整個生長期殺死肉雞,一年后在不同的雞群中再次出現(xiàn)。因此,我們決定對基因組進行測序,看看哪些抗性和毒力特征使該菌株獨一無二。”

研究小組對該菌株的基因組進行了測序,發(fā)現(xiàn)它包括 7 個抗菌素耐藥基因、120 個毒力基因和一個大毒力質(zhì)粒。質(zhì)粒是“可交換的”遺傳元件,可以在菌株之間進行交換,使它們更具抗生素抗性或傳染性。

“雖然我們不能說它是一種‘新的’沙門氏菌菌株,但我們可以說這種菌株不僅對家禽具有致命性、抗生素耐藥性和傳染性,而且還可能感染人類,”沃克說。“好消息是,通過對基因組進行測序,我們現(xiàn)在擁有的數(shù)據(jù)可以幫助確定未來爆發(fā)的起源并遏制任何爆發(fā)。”

該研究發(fā)表在獸醫(yī)科學前沿,并得到美國農(nóng)業(yè)部動植物衛(wèi)生檢驗局國家生物和農(nóng)業(yè)防御設施科學家培訓計劃的支持。全基因組測序由 FDA GenomeTrakr 項目完成,該項目由 1U18FD00678801 資助,在共同作者 Sid Thakur 的實驗室完成,Sid Thakur 是人口健康和病理生物學教授,也是北卡羅來納州和獸醫(yī)學院全球健康項目的負責人。北卡羅來納州立大學獸醫(yī)解剖病理學副教授博斯特為通訊作者。

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