人類(lèi) ALS 骨骼肌的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析揭示了 circRNA 失調(diào)的疾病特異性模式

一篇新的研究論文發(fā)表在Aging雜志上，題為“人類(lèi) ALS 骨骼肌的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析揭示了異常調(diào)節(jié)的 circRNA 的疾病特異性模式”。

環(huán)狀 RNA 是豐富的共價(jià)閉合轉(zhuǎn)錄本，通過(guò)反向剪接在細(xì)胞中產(chǎn)生，并在細(xì)胞和發(fā)育階段顯示不同的表達(dá)模式。雖然它們的功能在很大程度上是未知的，但它們內(nèi)在的穩(wěn)定性使它們成為許多疾病中有價(jià)值的生物標(biāo)志物。

在這項(xiàng)新研究中，來(lái)自美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院國(guó)家老齡化研究所、阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校、伯明翰退伍軍人事務(wù)醫(yī)學(xué)中心和 Cedars-Sinai 醫(yī)學(xué)中心的研究人員著手研究肌萎縮側(cè)索硬化癥(ALS) 中的 circRNA 模式。通過(guò) RNA 測(cè)序分析，研究人員首先鑒定出 circRNA 和線性 RNA，它們?cè)?ALS 的骨骼肌活檢組織中與正常個(gè)體相比具有不同的豐度。

“通過(guò) RT-qPCR 分析，我們證實(shí)在 ALS 中 8 個(gè) circRNA 顯著升高，10 個(gè)顯著減少，而由共享前體 RNA 產(chǎn)生的線性 mRNA 對(duì)應(yīng)物通常沒(méi)有變化，”作者說(shuō)。

這些 circRNA 中的一些在源自帶有 ALS 突變的人類(lèi)誘導(dǎo)多能干細(xì)胞 (iPSC)的運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中，以及來(lái)自 ALS 小鼠模型 (SOD1G93A) 的骨骼肌的不同疾病階段中也存在差異豐富。有趣的是，在 ALS 患者和 ALS (SOD1G93A) 小鼠的脊髓樣本中，一部分在 ALS 肌肉活檢中顯著升高的 circRNA 子集顯著減少?？傊?，研究人員在 ALS 相關(guān)組織(肌肉和脊髓)中發(fā)現(xiàn)了差異豐富的 circRNA，這些 circRNA 可以告知 ALS 中的神經(jīng)肌肉分子程序并指導(dǎo)療法的開(kāi)發(fā)。

研究人員總結(jié)說(shuō)：“隨著我們研究的推進(jìn)，我們將研究本文報(bào)道的 18 種 circRNA 中最有前途和最豐富的 circRNA 的功能。我們對(duì)那些似乎對(duì) ALS 具有特異性的那些特別感興趣，因?yàn)樗鼈兛赡苡兄诒碚骺梢宰鳛橹委熌繕?biāo)的疾病相關(guān)分子通路。”

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