通過在分子水平上識別癌癥的驅動因素，對腫瘤基因組進行測序的能力在過去 15 年中徹底改變了癌癥治療。但由于目前基因組測序的局限性，了解腫瘤內單個細胞的遺傳多樣性以及它如何影響疾病進展仍然是一個挑戰(zhàn)。
使用基于微流體液滴的單細胞測序方法，南加州大學的研究人員同時對近 1,500 個單細胞的基因組進行了測序，揭示了先前隱藏在經過充分研究的黑色素瘤細胞系中的遺傳多樣性。
該研究剛剛發(fā)表在Nature Communications Biology上，展示了單細胞測序揭示癌細胞可能進化軌跡的能力。
南加州大學凱克醫(yī)學院轉化基因組學研究所聯(lián)合主任 David Craig 博士說：“我們使用這種方法來檢查標準癌細胞系，并在許多不同的實驗室進行了數千次檢查。”研究作者。“這里真正令人驚訝的是，利用這項技術，我們發(fā)現了我們沒有預料到的復雜性。這條線實際上一直是不同類型細胞的混合物。重新審視這條線上數十年來的先前工作——現在有了這些新信息——我們有了新的對腫瘤進化的見解。”
獲得癌癥復雜性的高分辨率視圖
目前，腫瘤的遺傳信息通常是通過對數百萬個腫瘤細胞一起進行測序而不是單獨測序來獲得的。雖然這種方法提供了組織基因組成的廣泛視角，但它可能會漏掉腫瘤內與大多數細胞不同的少量癌細胞。
使用其他分析單個細胞 DNA 的方法，這個過程很費力，只需數周時間來處理幾個細胞，并且需要大多數實驗室沒有的資源。
對于這項研究，研究人員使用了一種稱為“單細胞拷貝數分析”的新興技術。由 10X Genomics 開發(fā)，采用新穎的分析方法，將這些結果與歷史方法的結果相結合。
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