導讀 大多數(shù)人都熟悉DNA雙螺旋。它之所以形成扭曲的梯子形狀,是因為構成我們基因組的長 DNA 片段完全互補——每個腺嘌呤都與一個胸腺嘧啶配對...
大多數(shù)人都熟悉DNA雙螺旋。它之所以形成扭曲的梯子形狀,是因為構成我們基因組的長 DNA 片段完全互補——每個腺嘌呤都與一個胸腺嘧啶配對,每個胞嘧啶都與一個鳥嘌呤配對。這四種核苷酸的序列包含在我們體內(nèi)構建蛋白質(zhì)所需的信息,但它們也編碼自己的雙螺旋結構。
然而,自 20 世紀 80 年代以來,科學家們劫持了這些配對規(guī)則來構建雙螺旋以外的結構。這個領域被稱為 DNA 納米技術,其最流行的實現(xiàn)方式是 DNA 折紙,研究人員可以將 DNA 折疊成任何形狀,為構建納米級設備和機器提供了強大的方法。
DNA折紙是將一段長的DNA(稱為支架)和數(shù)百個精心挑選的短DNA(稱為訂書釘)放在試管中,然后讓它們折疊在一起形成設計的結構。
該技術非常高效,整個過程只需一個實驗步驟即可完成。盡管表面上很簡單,但這個過程很復雜,科學家們對折疊過程中發(fā)生的事情沒有一個完整的了解。普通顯微鏡很難看到 DNA 折紙結構,因為它們太小,而且需要將結構附著在表面上。
試圖理解這一過程的一種方法是通過計算機模擬,使用一種稱為分子動力學的方法。研究人員過去曾嘗試使用這些模擬來了解 DNA 折紙結構折疊時會發(fā)生什么。然而,現(xiàn)有模型考慮了每一個核苷酸以及進化結構在數(shù)十億個微小時間步長內(nèi)所產(chǎn)生的運動。該過程對計算要求很高,限制了結構的尺寸和動力學模擬的時間。
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