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快速 自動識別單個(gè)活腦細(xì)胞

導(dǎo)讀 致力于在高清晰度、單細(xì)胞細(xì)節(jié)水平上了解大腦的研究人員設(shè)計(jì)了一種新的計(jì)算機(jī)程序,用于識別活體蠕蟲熒光顯微鏡圖像中的每個(gè)神經(jīng)細(xì)胞。以前

致力于在高清晰度、單細(xì)胞細(xì)節(jié)水平上了解大腦的研究人員設(shè)計(jì)了一種新的計(jì)算機(jī)程序,用于識別活體蠕蟲熒光顯微鏡圖像中的每個(gè)神經(jīng)細(xì)胞。以前嘗試自動識別單個(gè)神經(jīng)細(xì)胞的嘗試因同一細(xì)胞在不同蠕蟲中可能位于截然不同的位置這一事實(shí)而受挫。

這些蠕蟲是秀麗隱桿線蟲,一種在世界各地的土壤和研究實(shí)驗(yàn)室中常見的微小蛔蟲。動物 1 毫米長的透明身體中的 959 種細(xì)胞類型中的每一種都已被識別、命名和繪制,包括它們的 302 種神經(jīng)細(xì)胞。

科學(xué)家們于 1986 年完成了第一張秀麗隱桿線蟲神經(jīng)系統(tǒng)圖譜,此后一直在對其進(jìn)行改進(jìn)。最近的項(xiàng)目包括 OpenWorm,這是一項(xiàng)正在進(jìn)行的全球性努力,旨在設(shè)計(jì)逐個(gè)細(xì)胞且行為準(zhǔn)確的虛擬秀麗隱桿線蟲——一種具有研究價(jià)值的電子寵物。

盡管它們很有價(jià)值,但廣義腦圖譜,即所謂的連接組圖,仍然無助于識別單個(gè)活蠕蟲中的神經(jīng)元。“想象一下,如果你知道地圖上所有城市的名稱,但每次你看時(shí)城市都會移動。這就是它的樣子,試圖將當(dāng)前的大腦地圖集與生物體進(jìn)行比較,”東京大學(xué)的 Yuichi Iino 教授說,最近發(fā)表在BMC Biology上的研究論文的合著者。

Iino 的研究小組想要識別和繪制活的秀麗隱桿線蟲中的每個(gè)神經(jīng)細(xì)胞,以便他們能夠繪制出使行為、學(xué)習(xí)和記憶成為可能的電脈沖通路。

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