根據(jù)羅格斯大學(xué)的一項研究,可以根據(jù)對其基因組的專門分析來預(yù)測女性遭受最常見流產(chǎn)類型之一的風(fēng)險。
科學(xué)家們表示,這種洞察力可以讓患者和臨床醫(yī)生就生殖選擇和生育治療計劃做出更明智的決定。
羅格斯大學(xué)的研究人員在科學(xué)雜志《人類遺傳學(xué)》上報道,描述了一種將基因組測序與機器學(xué)習(xí)方法相結(jié)合的技術(shù),以預(yù)測女性因卵子非整倍性而流產(chǎn)的可能性——該術(shù)語描述了染色體數(shù)量異常的人類卵子。
不孕癥是一個主要的生殖健康問題,在美國影響約 12% 的育齡婦女。人類卵子中的非整倍體在不孕癥中占很大比例,導(dǎo)致早期流產(chǎn)和體外受精 (IVF) 失敗。
最近的研究表明,基因使某些女性易患非整倍體,但非整倍體產(chǎn)卵的確切遺傳原因仍不清楚。羅格斯大學(xué)的研究是第一個評估母親基因組中的個體遺傳變異如何預(yù)測女性不育風(fēng)險的研究。
“我們項目的目標(biāo)是了解女性不孕癥的遺傳原因,并開發(fā)一種方法來改善患者非整倍體風(fēng)險的臨床預(yù)后,”該研究的作者、羅格斯大學(xué)遺傳學(xué)系副教授 Jinchuan Xing 說藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院。“基于我們的工作,我們發(fā)現(xiàn)女性IVF患者的胚胎非整倍體風(fēng)險可以通過患者的基因組數(shù)據(jù)進行高精度預(yù)測。我們還確定了幾個潛在的非整倍體風(fēng)險基因。”
與新澤西州巴斯金里奇的一家試管受精診所新澤西生殖醫(yī)學(xué)協(xié)會合作,科學(xué)家們能夠使用一種稱為“全外顯子組測序”的技術(shù)檢查患者的基因樣本,該技術(shù)使研究人員能夠?qū)W⒂诘鞍踪|(zhì)編碼部分龐大的人類基因組。然后他們使用機器學(xué)習(xí)創(chuàng)建了軟件,這是人工智能的一個方面,程序可以在不遵循特定指令的情況下學(xué)習(xí)和做出預(yù)測。為此,研究人員開發(fā)了算法和統(tǒng)計模型,可以分析遺傳數(shù)據(jù)中的模式并從中得出推論。
結(jié)果,科學(xué)家們能夠根據(jù)女性的基因組創(chuàng)建特定的風(fēng)險評分??茖W(xué)家們還確定了三個基因——MCM5、FGGY 和 DDX60L——當(dāng)它們發(fā)生突變時,與產(chǎn)生非整倍體卵子的風(fēng)險高度相關(guān)。
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