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3月7日新的熒光 DNA 標(biāo)記揭示了納米級癌癥特征

導(dǎo)讀 匹茲堡,2022 年 3 月 4 日——研究人員開發(fā)了一種新的熒光標(biāo)簽,可以更清晰地了解癌細(xì)胞中 DNA 結(jié)構(gòu)是如何被破壞的。這些發(fā)現(xiàn)可以

匹茲堡,2022 年 3 月 4 日——研究人員開發(fā)了一種新的熒光標(biāo)簽,可以更清晰地了解癌細(xì)胞中 DNA 結(jié)構(gòu)是如何被破壞的。這些發(fā)現(xiàn)可以改善患者的癌癥診斷和未來癌癥風(fēng)險的分類。

該研究今天發(fā)表在《科學(xué)進(jìn)展》上,發(fā)現(xiàn) DNA 結(jié)合染料在處理過的臨床組織樣本中表現(xiàn)良好,并通過超分辨率熒光顯微鏡生成高質(zhì)量圖像。

“我的實驗室專注于開發(fā)顯微技術(shù)來可視化不可見的事物,”資深作者、匹茲堡大學(xué)醫(yī)學(xué)和生物工程副教授 Yang Liu 博士說。“我們是第一批探索超分辨率顯微鏡在臨床領(lǐng)域的能力的團(tuán)隊之一。以前,我們提高了其分析臨床癌癥樣本的通量和穩(wěn)健性。現(xiàn)在,我們有一種易于使用的 DNA 染料,它解決了將這項技術(shù)應(yīng)用于患者護(hù)理的另一個大問題。”

在細(xì)胞核內(nèi),DNA 鏈像繩子上的珠子一樣纏繞在蛋白質(zhì)周圍。病理學(xué)家通常使用傳統(tǒng)的光學(xué)顯微鏡來觀察這種 DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物或染色質(zhì)的破壞,作為癌癥或癌前病變的標(biāo)志物。

“盡管我們知道在癌癥發(fā)展過程中染色質(zhì)在分子尺度上發(fā)生了變化,但我們無法清楚地看到這些變化是什么。這困擾了我 10 多年,”同時也是UPMC 希爾曼癌癥中心成員的劉說。“為了改善癌癥診斷,我們需要以更高的分辨率可視化核結(jié)構(gòu)的工具。”

2014 年,獲得諾貝爾獎的超分辨率熒光顯微鏡發(fā)明是劉的愿景實現(xiàn)的重要一步。一個感興趣的分子被一種特殊的熒光染料標(biāo)記,這種熒光染料像閃爍的星星一樣閃爍。與使用不斷發(fā)光的標(biāo)簽的傳統(tǒng)熒光顯微鏡不同,這種方法涉及在每個時刻僅打開一部分標(biāo)簽。當(dāng)多個圖像重疊時,可以重建完整的圖片——分辨率比以前高得多。

直到現(xiàn)在,問題在于熒光染料在 DNA 或處理過的臨床癌癥樣本中效果不佳。因此,Liu 和她的團(tuán)隊通過將 DNA 結(jié)合分子 Cy5 和一種名為 Hoechst 的熒光染料與超分辨率顯微鏡的理想閃爍特性相結(jié)合,制定了一種名為 Hoechst-Cy5 的新標(biāo)簽。

在證明新標(biāo)簽比其他染料產(chǎn)生更高分辨率的圖像后,研究人員比較了來自正常、癌前病變和癌變病變的結(jié)直腸組織。在正常細(xì)胞中,染色質(zhì)密集排列,尤其是在細(xì)胞核邊緣。濃縮的 DNA 會發(fā)出明亮的光,因為更高密度的標(biāo)記會發(fā)出更強(qiáng)的信號,而松散堆積的染色質(zhì)會產(chǎn)生更暗的信號。

這些圖像顯示,隨著癌癥的進(jìn)展,染色質(zhì)變得不那么密集,核邊界處的緊湊結(jié)構(gòu)被嚴(yán)重破壞。雖然這些發(fā)現(xiàn)表明新標(biāo)簽可以區(qū)分正常組織與癌前病變和癌變病變,但劉說,超分辨率顯微鏡不太可能取代傳統(tǒng)顯微鏡進(jìn)行此類常規(guī)臨床診斷。相反,這項技術(shù)可以在風(fēng)險分層中大放異彩。

“早期病變可能有非常不同的臨床結(jié)果,”劉說。“有些人很快就患上了癌癥,而另一些人則長期處于前兆階段。對癌癥風(fēng)險進(jìn)行分層是癌癥預(yù)防的主要挑戰(zhàn)。”

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